?清帮与洪门有相当之渊源，但由于实行禅宗制度，所以与洪门中互称兄弟不同，青帮组织是拜师入帮，会众以师徒相称，崇尚“师徒如父子”。清帮组织比洪门更严密，规矩更复杂，于是也更加秘密。因此有言道：“清帮一条线，洪门一大片”。
倾向于行会性质的清帮并未如洪门般强调反清复明，但多少也认同这一思想，提倡“替天行道”。由于清帮并未积极从事反清活动，所以洪门一度将其当作叛徒，严禁洪门会员转投清帮，称“由清转洪，披红挂彩；由洪转清，剥皮抽筋。”。但为了避免冲突，两派仍多称“清洪一家”，所谓“红花绿叶白莲藕（指洪门、清帮、白莲教），三教原来是一家”。尤其清代后期，不少清帮弟子也开始反清，两派逐渐减少敌对。
青帮
青帮（正式称清帮）是中国历史悠久的帮会，雍正四年间翁岩、钱坚及潘清三人所创。徒众昔皆以运糟为业，故称粮船帮。大江南北，入帮者颇众。青帮是清初以来流行最广、影响最深远的民间秘密结社之一。
清帮主要以四庵六部作为行政管理中枢，所谓的庵，是依祖师而立的讲学堂与中央行政部门，相当于现在的府院,分别为朱寺庵、刘寺庵、黄寺庵、石室庵，这四个庵室，共通的部分便是罗祖教义传授，其余的则依祖师专长不同，而有所不同，朱寺庵的主讲师为翁祖，讲授的内容为禅学(临济宗派），以及武学（少林武学），此外下司辖兵部与刑部。刘寺庵主讲师为钱祖，讲授的则为经商交易之道与财务管理，并为工部之直辖主管机关。朱寺庵主讲师为潘祖，传授行运管理学论，教授古圣贤之道，且直接司辖史部与户部。石寺庵则为小爷仙逝后创立，主讲者为宿领帮，讲授帮规，授予新进人员义气千秋，及江湖礼节，可以说是职前训练所，另为礼部之直辖主管机关。
六部指的是吏部、礼部、户部、工部、兵部、刑部。这六部最初的主管，现在已不可考：
吏部专门编纂帮中大小事务，编写清帮史书，并将史书置于杭州家庙蔵经阁楼上，此外除了史书的工作之外，亦负责抄经管理罗祖书籍与家谱，然不幸的是咸丰四年太平天国之乱，杭州家庙遭太平军焚毁，以至於文件史料无存。
户部则负责管理人员，是清帮相当重要的人事主管部门，举凡拜帖进家，人员晋升，各方师父，均需投书予户部，由户部详列人员清册之中，最后年终综整后交予吏部，誊入家谱。
礼部则主管规矩仪注之订定与考核人员礼仪，并于每次开香堂时，主持规划与邀请各方老大到场，同时亦负责审核人员进家之三帮九代是否合乎规矩礼法，并于香堂设立时担任执堂师一职。
工部则责于各项帮中工程，如造船，维修，后勤补给，香堂搭设等工作，是清帮效率挺高的工兵小组，所有各帮维修人员，均为工部管理，并接受一般民众委任修船及其它建设工作。此外工部亦为清帮的基本会计部门，全帮所得计算与管理均为工部之责，清算后呈报刘寺庵。
兵部则为遇外敌时，统筹规划作战之部门；清帮弟子在外，难免与其他会社起些冲突，当冲突无法解决时，会先派出谈判小组，这各帮的谈判小组，归兵部管理，当事情仍无法解决有可能发生战争时，谈判小组会将问题回报与兵部，兵部则开始调动可用人力，实施战斗准备。香堂开设时，每香堂的左右护法，则由兵部派立。
刑部则为清帮的执法单位，当门下弟子犯有帮规时，各方师父会依情节轻重，回报予刑部，最后由刑部设立刑部香堂，对不肖弟子实行惩处。另外，不论开立何种香堂，门外与门内的巡堂师（内外刑堂），则由刑部派立。
传承
第一代清字辈指的是金纯，号碧峰，明末南京麒麟门外金家村人氏，乃弃官出家的僧人。金纯使用了据说是达摩老祖定下的前后四十八字作为派系，于是他的法名，便叫做“清源”。第二代静字辈有罗清，甘泉县（或甘肃省）东乡罗家庄，万历三十年赐进士，天启三年拜户部尚书，出家后法名“静清”。陈瀛，字易水，道号静海，东广西林贵县人。第三代道字辈有陆飞，字羽飞，道号为道行，广东娥素人氏。赵大官，字悟本，道号为道元，金陵霞邑人，明末进士，崇祯年曾任统兵之职。第四代翁岩、钱坚、潘清三人乃德字辈，为纪念祖师，前三字“清、静、道”清帮后代不再使用。第二十一代“大”字辈，青帮在1919年的上海召开恳谈会时记载有：步章五、吴省三、高士奎、荣华亭、张蔚斋、李春利、龚谨成、梁绍、刘登阶、张树声、赵德成、曹幼珊、袁克文、周荩臣、李琴、阮慕白、程孝周等十七名。
入门规定和阶级晋升制度
清门强调帮中伦理，任何一位欲进家门人士，必先经过重重考核，一般而言，欲进家学生得先拜帖，在拜帖中详细写明自己的家世背景，职业工作与姓名八字，然后由三帮九代开设寄名香堂，经过香堂仪式洗礼之后，仍不能算是真正清帮内人，此时称为一脚门内一脚门外，师父会在这寄名后的三年内，勤加考核，这个阶段称为师访徒三年，三年后必需由学生勤访师父三年，让师父考核其是否真有决心进家，这个阶段，称为徒访师三年，经过六年的考验，确定学生的决心于品性后，师父则会开始教导其基本仪注，或委由石室庵教导，经过一年的学习，通过后，则师父会择吉日，并报请户部，由户部开始做开设香堂之准备并通报四庵六部与学生之三帮九代，让学生晋任小香。此时方成为正式的潘家子孙。小香学生得学习待人处世应对进退之道，以及各庵堂所讲授之基本课程。
小香阶段经过三年考核，师父会考量学生的学习是否方向正确，是否忠于家门，应对进退是否合宜，若一切合乎条件，则再报请户部开设大香堂，户部同样会通报四庵六部与学生之三帮九代，择吉日帮学生晋任大香，大香阶段的弟子，可以称为储备师父，他们不仅得具备小香所学的技能与知识，主要得学习如何领帮带众，传道传法。
当师父认为，此大香弟子已备足能力，可以领帮率众时，则会以相同程序，开设开法香堂，授予弟三锁三钥与六字真言，从此後，弟子已可独当一面，接续祖师香火，收徒领帮，不论何字班辈，一见开法师父，即使是晚辈，亦不再以辈分称其弟佬或称徒孙，而直称其为”某师父”。这是对帮中能独当一面收徒领帮，延续香火者的尊重。
以现代而言，不一定得受到七年进家的限制，古时所订定的这种规矩，系因为访师访徒不易，路途太遥，或因为弟子师父工作忙碌之故，故而延长进家时间，主要是让师父徒弟皆能充分明了双方情况。寄名香堂现在几乎也不开设，仅以口头寄名与接受拜帖后即算数，且现代交通便利，所以七年进家，此规可守可不守。
辈份称呼
清帮虽为翁、钱、潘三位祖师所创，然草创之初，翁、钱二位祖师爷先后仙逝，潘祖独撑大志，与门下弟子共同订定家规法则，劝戒帮众修德论道，将一帮市井船夫，治理的有条有序满帮是良才，强调师带徒的体制，帮中大小以字辈论之，严然是个大家族，并设立家庙，凡入帮者，不论何姓，一旦入帮，均为潘家子孙，因此不仅仅是入帮会，而是入家族，且不论何字班辈，一师皆为师，一徒皆为徒，受四方长辈恩下，也使得清帮有别于其他帮派会社，师徒兄弟间感情特别亲切。
长辈的称呼：不论何帮，大一辈者，本命师与众已开法之师父，均以某师父称之；未开法大一辈之长者，则不论男女，均称为师叔；大二辈者不论为哪一帮头及是否开法，均统称为某师爷；大三辈者则不论何帮及是否开法，均称为师太；大四辈则不论何帮及是否开法，统称为太师太；大五辈本帮几乎没有，若真有那便称为祖节。
平辈的称呼：同参一师者称为亲同参，同一师爷之分系同辈，则称为同参，引进或传道帮头之同辈弟子则称为同山，其他非三帮九代帮头之同辈，称为平香。
晚辈的称呼：某师父的儿子，一律统称为小老大；徒弟或是同辈的次子或儿女，则称为少君，弟佬的儿女或徒弟，则称为法孙；法孙的徒弟或儿女，则称为少法孙；若还有以下，则称为法将。
根据青帮的「家谱」记载，青帮的辈份可分为前廿四代、后廿四代及绩廿四代派等叁个辈份接续：
前廿四代依序为清、净、道、德、文、成、佛、法、仁、伦、智、慧、本、来、自、信、元、明、兴、理、大、通、悟、学。
后廿四代为万、象、皈、依、戒、律、传、宝、化、渡、心、回、临、持、广、泰、普、门、开、放、光、照、乾、坤。
续廿四代为绪、结、昆、计、山、芮、克、勤、宣、华、转、忱、庆、兆、报、魁、宜、执、应、存、挽、香、同、流。
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