这段时间里，科尔森的新神盾局，工作是卓有成效的，他们不仅摧毁了九头蛇企图毁灭新神盾局的阴谋，而且还跟美国政府达成了一定程度上的共识，神盾局将不会再遭受美国政府的通缉。
不仅如此，科尔森还从档案里找到了在他之前接受过GH血清的几名前神盾局探员，他们都是因为得到了绝症或者是身受重伤，在不得已的情况下接受了GH血清的治疗。
他们这些人根据脑海之中残留的外星人记忆，各自得到了不同的刻纹，而科尔森最后将所有的刻纹全部都组合在了一起，最后得到了一座城市地图，一座古老的城市地图。
新神盾局用于搜索地图所在城市的卫星网络位于夏威夷欧胡岛的卡依纳角，而那里却是由美国空军所控制，守卫森严，一般人根本无法轻易潜入，所以科尔森带着斯凯、霍普，还有菲兹一行人来到了澳大利亚。
一旦卡依纳角基地信号瘫痪，澳大利亚这处小基地的就会上线，然后他们便可以在这里进行搜索。
所以在这之前，科尔森已经提前进行了准备，他悄悄的替代了两名即将进行职务交替的军方官员的手表和纽扣，而当这两人在卡依纳角基地进行职务交替时，分开无害的手表和纽扣在这个时候，就会形成完整的特洛伊木马病毒信号，上传并将整座基地的信号瘫痪。
然而就在他们赶到澳大利亚基地的时候，却发现九头蛇的人的提前一步抵达了这里，不过科尔森他们还是很快就清除了九头蛇的人，不过战斗中霍普被人击中胸膛。
而这个时候，一个自称医生样貌粗狂的男人站了出来，如果凌霄在这里一定能够认得出他就是斯凯的父亲。
虽然斯凯的父亲做了许多的遮掩，但是他一句无心的话，却暴露了他的身份，不过他还是以崔普的性命作为要挟，顺利的从科尔森的手里脱逃，而科尔森也从他的嘴里得知了许多怀特霍尔最新的动向。
与此同时，斯凯也在这段时间里将所有的热成像和探底成像的卫星地图都下载了下来，毕竟那座城市现在并不在地表之上，而在地面之下，正是因为如此，他们才不得不跑这一趟。
事后，科尔森也告诉了斯凯他父亲曾经在基地出现过的事情，两人紧紧相距不到几百米，还有他利用受伤的崔普威胁科尔森的事，科尔森也没有隐瞒，斯凯听了之后情绪十分复杂。
之后经过对卫星地图数小时的搜索，对地球多谱地形扫描地图搜索，甚至深入海洋地壳数英里，他们终于找到了3D模型与城市吻合的古岩层，最后确定了城市所在的位置就在波多黎各首都圣·胡安市。
古老城市大部分接近地表的通风井都已经陷入了地底或者是大海中，只有在圣·胡安市的老城区还有一处通道可以通行，而他们也将从那里进入地下古城，当然，他们得先派一支测量队检测隧道结构的完整性。
而根据科尔森的计划，他们在找到神庙之后，将会直接炸毁它，但是真神盾局的那些人却有不同的意见。
凌霄对于科尔森的神庙计划并没有兴趣，神庙当中能有什么，什么都没有，那里只是方尖碑发挥效用的地方，没有方尖碑，没有神庙，没有能够触发血脉能力的异族人，凌霄很难从那里面得到什么价值。
而现在他真正感兴趣的瑞娜，瑞娜是除斯凯以外，第二个能够碰触方尖碑的人，毫无疑问，她的体内也拥有异族人的血脉，相比于被其他人牢牢守护着的斯凯，瑞娜要好下手多了！
在这段时间里，经过了凌霄改造的格兰特·沃德已经见到了怀特霍尔，尽管巴克希失踪的事情让所有人都有些紧张，但是很明显怀特霍尔并不知道是沃德将巴克希送到科尔森手上的。
而且在怀特霍尔这里，沃德见到了斯凯的父亲，经过了特殊改造的格兰特·沃德清晰的感受到了斯凯父亲心里深深压抑着的是对怀特霍尔的强烈憎恨！
正是斯凯的父亲，向怀特霍尔提供了瑞娜能够拿起方尖碑的事实，这才派出人手来围捕她。
格兰特·沃德并没有亲自参与这件事情，毕竟现在的他还没有完全获得怀特霍尔的信任，这个时候，他的行动还被拘束在怀特霍尔的九头蛇秘密基地里。
此时的瑞娜还不知道危险的逼近，她现在在加拿大温哥华，最近的她以一名在全世界旅游的孤独女子的身份傍上了一个有钱的美国佬，并且劝说他下一步去亚洲，去上海。
就在美国佬晕晕乎乎的，被答应之际，一个熟悉的声音突然响起：“你好啊，瑞娜！”
“是梅特工啊！”瑞娜对着这个带着墨镜，侧对着她的梅琳达有些不耐烦的说道：“既然你们已经给我植入了追踪器，就不用再追踪我了。还是说你是特意过来打招呼的……”
瑞娜的话有些说不下去了，因为她眼前的这个“梅琳达”已经摘下了眼镜，露出了半张梅琳达的面孔，还有半张被电流烧伤的左脸，同时如同恶魔一样的狞笑声说道：“瑞娜，怀特霍尔博士想要见你一面。”
瑞娜原本是在为斯凯的父亲在工作的，之前她从九头蛇和神盾局双方的手里抢走的方尖碑，就是交给了斯凯的父亲，可是她也因此而同时得罪了九头蛇和神盾局。
科尔森的新神盾局倒也还好，君子可欺之以方，可怀特霍尔的九头蛇就没有那么好对付了，怀特霍尔博士亲自出面找上了她，威胁她必须要将方尖碑交出来，不然就杀了她，这个时候，瑞娜不得不回去找斯凯的父亲。
瑞娜和斯凯的父亲之间的关系比较复杂，瑞娜早年是一个流浪儿，是斯凯的父亲在她被饿死的边缘救了她，而斯凯的父亲本身是一名医生，他通过化学实验让自己变得更加的强大，但是也更加的不稳定。
而瑞娜的存在却能很好的平息他的这种不稳定，所以在瑞娜成长的那几年，斯凯的父亲倒也没有怎么爆发过，直到瑞娜长大之后，斯凯的父亲便派她出去寻找他的亲生女儿，而他自己则是待在一个老旧社区里，很少离开。
双方是一种相互依存，相互需要的关系，在怀特霍尔的威胁下，瑞娜不得不回头来斯凯的父亲，想要从他手里拿走方尖碑，然后交给怀特霍尔，但是她却被一心想要找回女儿的斯凯父亲给拒绝了，但也最后留下了一个希望给她，想要拿走方尖碑，把斯凯带来见他。
瑞娜无意中在九头蛇大楼里看见西蒙斯，西蒙斯正将信息传送给神盾局，在一旁的瑞娜看在眼里。
确定了西蒙斯是科尔森派在九头蛇的卧底，拿到了这一把柄，瑞娜便直接打来电话约见科尔森。
很快两人就见面了，科尔森希望瑞娜能够将方尖碑给他，但瑞娜却是将西蒙斯是卧底九头蛇的照片给科尔森看，并且提出想要让她删掉照片，科尔森就得让她带走斯凯去见她的亲生父亲，但科尔森并没有答应。
谈判无果，恼怒之下的瑞娜将西蒙斯的照片发给了九头蛇的所有雇员，西蒙斯被人追杀，没想到被同样卧底在九头蛇的芭芭拉所救，两人同时回归神盾局，瑞娜的计划失败。
瑞娜眼看自己计划失败，想要投靠神盾局，来摆脱九头蛇的威胁，但是科尔森并不答应。他希望瑞娜能够将斯凯父亲的地址告诉他，然后利用瑞娜设法接近怀特霍尔，瑞娜没有办法，只能将地址告诉给科尔森。
等他们来到那座老社区时，斯凯的父亲已不见了踪影，而斯凯则是在地下室见到了许多她父亲为非作歹的证据，决定有亲自捉拿他，而在暗中监视这一切的斯凯父亲，则是眼见到自己的亲生女儿如此憎恨自己，一时痛苦万分。
他将这一切都归于科尔森的蛊惑，发誓一定要杀了他。
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