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客观的来说，现在的工业基地发展是畸形的。作为成熟的工业体系，除工业生产单位外，还包括一，管理基地的行政管理部门和附属的研发机构；二，从事原材料采掘，加工的厂矿；三，为生产厂矿服务调运的单位。
对比现一下，可以发现，现在工业基地民用加工厂虽然发展势头良好，但缺乏生产新产品的技术支持；军事工业的发展就更显得单薄，产品只能生产简单的矛，弓箭，研发新产品能力几乎为零。
农，军加工厂的不平衡发展，是现在工业基地的最大的问题，而缺少工业新产品研发能力，则是其中发展的瓶颈，解决之道，就是建立一个专门负责研发的机构——科技研究院。庄拓在建工业基地中，疏忽的就是研发新产品的研究院。
“亡羊不牢”，终究不迟。何况庄拓现在是摸着石头过河，每走一步都小心翼翼。虽然猜到了开始，当却猜不出这结果，他不是神，只是芸芸众生中平凡的那一个。
用这些安慰麻痹了神经，庄拓恢复了他自信满满的性格。“就当再补一次牢吧。”此刻他的心理开始准备研究所的事宜
研究所的地点定在俞元坝东北，华山脚下，前有一龙潭，涌着一泉清水。后有4000平米的坡地，坡地后陡壁悬崖者，就是华山。庄拓决定把研究所建造在坡地上，坡地前挖一条沟，把泉水引到沟中，就成了护所河。建成后，在沿河建一线高墙作障碍，只留一条道进出，并派一支军队保护。这种地守人防的因素加在一起，安全是没有问题的。
研究所，对外的名字叫太学，方正这里建成后看到最多的就是人，谁管他们的身份。
研究员的来源，分成了二部分，一部分是穆子招募的滇国的奇人异士，另一部分是庄拓从汉地高薪挖来的能工巧匠。可算是聚天下精英为一炉了。
研究的方向，庄拓考虑了一下。还是根据产品用途，分成民用所和军事武器所。
另外，作为配套的医院，食堂，宿舍，办公室，也要建设。
在房屋建盖得差不多的时候，研究人员也到齐了。庄拓集中所有人员开了个会。
会上首先做了个自我介绍，接着把研究所的目的和大家说明了一下：就是研发新产品。跟着有介绍了待遇方面的问题：月工资是加工厂工人的10倍，研发成果按价值大小给予奖励。
在这之后，就开始着重的谈研究所的保密工作，具体的内容包括：1，不能擅自外出，有急事必须提前申请，批准之后，才能出行；2，每月休息4天，遇特殊情况推后休；3，不得把研究所的项目情况，对外泄密，违者将重处；4，出入研究所大门要配合守军的检查，出示门条。
为体现民主，庄拓让所有人在三天内自愿签定《保密条例》，如果不愿意留下的，他发路费回家。他的原则是，“君不密则乱其国，臣不密则亡其身”，研究所的工作，一切必须在建立在保密的前提下。
说完这些，这次会议也到了尾声。在宣布散会后，他要做的就是等待人员的去留问题了。
研究员这边，他们中的绝大多数，都是出来做事——这是前提；在者，这里的待遇在他们看来简直不能用“高薪”来形容，而是天价。最后，“抬人饭碗，受人管”的道理，他们还是懂的。不到三天，所有人就签定了条例。这样的结果，令庄拓更自信满满：资本家的手段，不一般！
签定条理之后，根据个人情况分到岗位后，研究院的工作就开始了。在开院之前，庄拓购买了常用设备，同时凭着对历史的所学，写了研究项目和绘制了一部分草图。
这些项目，民用方面有：农业类是曲辕犁；风车（农用，印刷术，造纸术，水排（李铭一直没有研究出来）；耙；蓑衣；草鞋；碓；竹笼；撮箕；连枷；木制打谷机；水车；纺车；水库结构。商业类有：交子，算盘，称，木制货车改良，银行（钱庄）……。这些项目涵盖了以后2000年的历史。
项目的军用方面有：火药，指南针，攻城车，抛石车，兵车，铸铁火炮，盔甲战靴，强弓，匕首，军用铲，被服，勋章，军衔章，改良军马，军阵，象兵战术，城墙改良……这和帝国时代有得一拼了。
研究员进了研究室后，看到庄拓为他们准备的设备，感叹不已，但看到所列项目，不仅茫然，这些东西，有的可以想象下，有些连名字也读不出来。还好有些图纸，可以仿制一下。
研究院的工作一开始就是从仿制开始的。尺寸，材料，各部件衔接，实验，错了再来，不行再做，研究员就这样开展着他们的工作。
庄拓每天也抽出一，两个小时来看下各个研究室，遇到不懂的问题，他可以指点一下，他不懂的，则有研究员自己琢磨。只是，每当研究员拿问题来问他时，他总在关键的地方说出一二三来，让研究有了进程。一来二去，他在研究员的眼里就成了神人，遇到问题就来找他。觉察到这些后，庄拓到实验室的时间就少了许多，他是怕形成依赖。另则，他也有他的烦恼。
科技研究院是建立起来了，事情也有了进步。但在实验中，有的材料和图纸，就算他想尽办法，也没有进展，这就是他的烦恼。
想做事情，一不知从何做起的烦躁，让庄拓郁郁寡欢，没几天，他就病了
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